BIPEDD-2 es la segunda edición de un Programa de investigación (S2010/BMD-2457) financiado por la Comunidad Autónoma de Madrid (CAM) cuyo objetivo fundamental es el abordaje y la resolución de los problemas inherentes a la identificación de moléculas bioactivas, la optimización de prototipos mediante técnicas bioinformáticas de cribado virtual y el diseño de ligandos basado en la estructura del receptor. BIPEDD-2 aglutina a un equipo pluridisciplinar de expertos internacionales en biología estructural, química farmacéutica, química computacional y bioinformática, y tiene su origen en la plataforma bioinformática de descubrimiento de fármacos BIPEDD desarrollada en la CAM mediante la ayuda concedida en 2006.
La plataforma se aplica en áreas de gran relevancia terapéutica, como son (i) infecciones producidas por bacterias, virus y parásitos protozoos, (ii) enfermedades neurodegenerativas y (iii) procesos cancerosos. De este modo, el proyecto aúna y vertebra los intereses comunes de una serie de grupos multidisciplinares con el objetivo de cubrir las etapas preclínicas de (1) caracterizar estructuralmente nuevas dianas, (2) identificar posibles ligandos a partir de quimiotecas reales y virtuales, (3) caracterizar la interacción ligando-receptor mediante técnicas biofísicas y/o funcionales, y (4) valorar la actividad biológica de las moléculas candidatas.
Además del aspecto puramente científico, la práctica totalidad de los componentes del equipo mantienen una participación activa en distintos programa formación de proyección nacional e internacional que se amplia regularmente mediante la celebración de talleres y cursos específicos. Es de esperar, por tanto, que el conjunto de actividades planteadas en BIPEDD-2 tenga un efecto dinamizador de la actividad empresarial de la CAM en el área de la Biotecnología y la investigación farmacéutica básica. Finalmente, merece la pena destacar que una de las principales empresas dedicadas al descubrimiento y desarrollo de nuevos fármacos radicadas en la CAM, PharmaMar, participa activamente en el programa BIPEDD-2.